洪承畴降清后，皇太极命隶镶黄旗汉军，表面上对他恩礼有加，实际上并未放松对他的防范，使其在家，不得任意出入。终皇太极一朝，除咨询外，也没有任以官职。

清顺治元年（明崇祯十七年，大顺水昌元年）四月初九日，洪承畴从睿亲王多尔衮率军十万大举南下攻明，十一日至辽河，得知大顺军已攻占北京、朱由检自缢，遂用洪承畴之谋，“出其不意，从蓟州、密云近京处，疾行而进”，直趋北京。

四月十三日，李自成亲自统领大军，进攻吴三桂，企图夺占山海关。十五日，多尔衮率清军行至翁后所，接吴三桂乞求合兵攻李自成书，立即改变进军路线，日夜兼程，急驰山海关。

二十一日晨，李自成军抵山海关，在石河及东、北、西三面全线发起进攻，吴军濒临危殆。二十一日夜，多尔衮率清军抵达关外的威远城，击败大顺军唐通部。二十二日晨，吴三桂剃发称臣，开关出迎清军。中午，蓄势伺机的清军骑兵在英王阿济格、豫王多铎率领下，突然从吴军阵右杀出，农民军猝不及防，最终失利，由水平（今河北卢龙）退回北京。二十九日，李自成率大顺军仓促西撤。多尔衮命吴三桂向西追击，自统清军直趋北京。

洪承畴建议：“我兵之强，流寇可一战而除，今宜先遣官宣布王令，示以此行特期于灭贼，不屠人民，不焚庐舍，不谅财物之意。仍布告各府县，开门归降，官则加升，军民秋毫无犯。若抗拒不服，城下之日，官吏悉诛，百姓仍予安全。有首倡内应者，破格封赏。此要务也。”多尔衮采纳他的建议，于山海关击败李自成的农民军后，向明朝官民发布出师告示，结果大军所过州县及沿边将吏皆开门款附，收到极大的政治效果。

清兵入京后，顺治帝对洪承畴十分器重，以洪承畴仕明时的原职衔任命他为太子太保、兵部尚书兼都察院右都御史，入内院佐理军务，授秘书院大学士，成为清朝首位汉人宰相。

洪承畴建议清延采纳许多明朝的典章制度，完善清王朝的国家机器，献计甚多，大多被顺治采纳，加以推行。如恢复明代的内阁票拟制度，以便大学士对用人行政等要务能有所指陈，六科也可以据以摘参，从而达到杜渐防微的目的。他还建议九卿科道会推督抚提镇官员实行保举连坐法，慎重用人行政。

从这一点看出，如果没有汉人的帮助，清军要想入关就很困难，更别说君临天下。

赵谦此计，目的便是想尽力改变汉人的悲观情绪，影响世态人心。

邹维涟又说道：“只是……眼下东夷军已到达徐州，我军如全军自水路北上，恐淮安刘泽清投降东夷，南京失去缓冲，万一城破，那时我等该如何是好？”

“……况左翼武昌左良文最不可信任，为我制肘，庐州黄得功亦不可信任，要是他们打着清君侧的旗号，乘南京空虚而入，也不是不可能，大人不可不防啊！”

赵谦等人听罢默然，邹维涟所说的并非是耸人听闻，确实存在这个可能。据锦衣卫密探的暗查，淮安的刘泽清投降的可能比较大。还有左良文，赵谦是他的弑兄仇人，也极可能进攻南京。

张岱用拳头轻捶了一下桌子，茶杯与盖子撞得叮当作响，张岱恨恨地说道：“这些人，名为明臣，实为明贼，不但用处不大，反而制肘朝廷，真是该杀！”

赵谦沉声道：“从福建和杭州调集各地守备兵马，拱卫南京，只需两个月，我们便能达到斩首目的，届时再回师南京，击溃敌军。”

邹维涟想了想道：“福建兵力不加，各城都很空虚，最多可以调出一万人马。”

史可法道：“浙江乃赋税重地，如果抽离兵力，万一遇乱无法平息，恐影响海贸，关系整年收入。”

赵谦埋头想了许久，抬起头说道：“整个大明都处于悲观情绪之中，世人纷纷想要投降，我等定要抓住这次战机，打破颓势。不愿冒险，不思进取只有坐以待毙。我打算从福建调集一万兵力，由史可法统率坐镇扬州。南京尚有两万守备，邹维涟领南京守备防备左良文，坚守两月，你们可能办到？”