秉礼司：掌管寺社祭祀、陵寝之礼乐及制造典守事宜，负责与皇室对接；

营缮司：掌管全国工程事务，各地城池修缮普请皆需按规定向其报请批准；

勘合司：掌管海外贸易，由秀保直接委派大名兼任。

九曹，作为秀保直属的政策执行传达机构，类似汉代丞相府中的曹属，直接听命于秀保，负责将七司的决策和建议递交给秀保进行最终决断，拥有对七司政策的指导权和建议权，多由秀保谱代家臣担任最高长官“曹掾”。虽说名义上只是秀保的私人机构，但实则成为压制和削弱七司的重要力量。主要包括以下九部分：

兵曹：又称东曹，军势征调的最终审核和报批，大名麾下军势规模摸排和督查，对接武卫司；

吏曹：又称西曹，各地代官、大名家老变动的最终审核和报批，对接布政司；

市曹：负责全国各地市井治安的维持（有专属军势），大名城下町建设的最终审核和报批，对接布政司；

刑曹：刑法政令的最终审核和报批，对接都察司；

户曹：户籍、军需的最终审核和报批，对接度支司；

税曹：税收征缴入库、政策制定的最终审核和报批，对接度支司；

奏曹：主掌与皇室、寺社对接，与“武家传奏”关系紧密，对接秉礼司；

工曹：各地工程建设、城池普请的最终审核和报批，对接营缮司；