在事件平息后，流言四起，因为宇智波一族没有参与九尾事件，引发了村民的误解和不满，可是木叶高层并没有出面解释此事，而是调整村中各族的布局，将宇智波一族安插到边缘地区，并使之处于被各大家族制衡与监视的位置。

在此高压之下，宇智波一族终于无法忍受，他们在暗中策划着一场政变。

这时距离九尾之乱已经过去了两年，木叶村已经从当初的阴霾走了出来，即便自来也和纲手不在村中，还有三代目火影、志村团藏和日向一族等强大的族群作为村子的护盾，而宇智波族内最强的只是宇智波止水，族长宇智波富岳和宇智波鼬三人而已。

除了宇智波止水的实力达到影级，年少的鼬和族长富岳都是精英上忍的级别，政变获胜的几率不高。

就算在木叶村强大的忍者都外出执行任务时政变成功，可在自来也等人归来之时，宇智波一族也没有足够的力量抵抗。

所以，这是一场成功几率非常低的政变，作为一族之长的宇智波富岳又怎么可能不清楚，但他同样明白，即便不发动政变，木叶的高层也不会一直留着他们。

然而，木叶的高层早就察觉了这场政变，做好了充分的准备，并且让人对宇智波止水施压，让他协助剿灭参与叛乱的宇智波族人。

宇智波止水明白这场政变无论成功与否，都会对木叶村造成极大的危害，被严重削弱的木叶到时会被其他忍村趁火打劫，到时宇智波一族的局面不但会更加难看，而且还会成为挑起叛乱的罪人，到时在整个忍界都会无处容身。

最终，他直接找到猿飞日斩，想用生命换取宇智波一族的平安，他告诉三代目族人之所以有叛乱的想法，是因为自己瞳术的强大，如果自己死去，一定会断了他们叛乱的念想。

“宽容”的三代目竟然同意了，还告诉止水一定会尽可能的善待宇智波族人。

在这之后，宇智波止水在鼬的面前自尽了，并且把眼睛托付给了这个族中他最亲近的人，和他预想的一样，这次政变因为他的死去后宣告终结。

但宇智波富岳知道这件事并不会结束，因为宇智波一族始终像一根肉中刺一样钉在木叶村中，这根刺对于历代火影来说都是必须要拔出的东西，现在不拔只不过还不到时候罢了。

猿飞日斩看似遵守了承诺，并没下令剿灭宇智波一族，但木叶高层对他们一族的打压却从未停止过，如此下去宇智波一族只会越来越衰弱，最后沦为极为弱小的族群，到时日斩就会以随便一个什么借口，将其连根拔掉！

但他没有办法，止水的死去让族中失去了唯一一位影级别的忍者，此时的宇智波一族是木叶建立以来最为衰弱之时，根本没有力量政变，因此他决定隐忍，等待鼬成长起来。

宇智波鼬在亲眼目睹止水死去后，开启了万花筒写轮眼，在两年后实力已经不输于当年的止水，达到了影的级别。

如今的木叶村紫猿飞日斩和志村团藏的通力配合下空前鼎盛，日斩以宽容、缓和的态度度安抚，而团藏却在黑暗的深处打压，在他们的怀柔政策与威逼利诱不断压迫下，宇智波一族逐步衰弱，族人此时都明白宇智波灭族只是或早或晚的事。