张让、段珪伏诛，少帝回宫，六玺俱在，而独失传国玉玺，这是传国玉玺第一次从所有的记录中消失。

不久，十八路诸侯讨伐董卓，长沙太守孙坚攻入洛阳，从城南甄宫井中捞出一宫女的尸体，在其项下锦囊朱红小匣中得到玉玺。玉玺方圆四寸，上携五龙交纽，旁缺一角，以黄金镶补，下有篆文：受命于天，既寿永昌。

孙坚获传国玉玺，心生异念，将其秘藏于妻吴氏处。

后来孙坚身亡，袁术得到传国玉玺，称帝。

袁术死后，其妻扶棺奔庐江，又被荆州刺史徐璆把传国玺抢去献给了曹操。

后来曹丕篡汉建立魏国，画蛇添足，派人在传国玉玺的肩部刻下隶字“大魏受汉传国玺”。

西晋统一三国，传国玉玺归司马炎。

晋怀帝永嘉五年，王弥攻入洛阳，俘晋怀帝并得传国玉玺。

作为少数民族统治者的刘聪，还不懂得传国玉玺的意义，他把晋怀帝和传国玉玺都迁到平阳看押起来。

刘聪死后，大将军靳准作乱，要把传国玉玺交给胡嵩，胡嵩不敢接受。

不久靳准被杀，靳明遣卜泰献玺于刘曜。

石勒杀刘曜，得传国玉玺，又自作聪明的在传国玉玺的另一边刻上了“天命石氏”四个字。

后赵传至石鉴，内乱，冉闵杀石鉴，夺玺，传子冉智。

公元352年，慕容俊攻克邺城，宣称闵妻已献传国玉玺，封其为“奉玺君”，改年号为“元玺”，建立大燕国。

然而所谓的献玺之说只是慕容俊导演的一场骗局，是想给自己的统治找到一个正统的说法而已。其实当时濮阳太守戴施以出兵救援为名，从冉魏大将军蒋干手中赚得传国玉玺，遣都护何融怀玺至枋头，交给晋安西将军谢尚，谢尚又将传国玉玺送至建康，至此，传国玉玺历经四十二年流转而重新归于晋。

后来晋恭帝禅位于刘裕，传国玉玺归宋。